Kristoffer Joner er nevø  av skuespiller/sanger Johannes Joner og komponist/musiker Sverre Indris Joner. Bestefaren var jounalist, og noen ganger underholdningsartist, Knut Joner. Med disse to laget han familieforestillingen Joner & Joner & Joner . Joner var medlem av  Rogaland Barneteater fra 1987 til han var i begynnelsen av 20-årene  , deltok her i musikaler som "Bugsy Malone"

Joner har vært medlem av rockebandet Single Satellites .Han hjalp sin medskuespiller fra Mongoland,  Reidar Ewing, med låtskrivingen på platedebuten. I 2004 var han med i musikalen "Alt for Egil", skrevet av Tore Rygh og Tore Renberg. Han sang låten "Fotballskonå" skrevet av Tor Salomonsen og Sverre Kvam på supporteralbumet "Viking i Hundre", og "Påpirbådar" på "Gode hjerter 2"